Eu acho que o fato do sifão não ser vedado não é um grande problema, uma vez que o ar aspirado sempre vai buscar o caminho mais fácil. A falta de vedação só seria relevante se tubo estivesse imerso na água.
Filtro esportivo, tecnicamente solucionaria o problema de aspiração de água, mas o ar quente no cofre, certamente alteraria alguma coisa. Talvez não seria tão relevante no desempenho, mas sim nas questões de emissões de poluentes (que é a preocupação das fabricantes).